Comment Full Canopy Genetics et Valenveras apportent des données à MycoBag

Chez MycoBag, nous relions les données de culture à des mesures analytiques. Full Canopy Genetics et Valenveras travaillent ensemble pour comprendre en quoi les échantillons de champignons diffèrent en rendement et en composition chimique, Hydra figurant parmi les variétés du catalogue actuel de MycoBag.

Ce travail remonte à nos premières mesures de champignons à Denver, dans le Colorado, en 2023. Aux côtés de Santiago Ongay de Full Canopy Genetics et d’autres collaborateurs, nous explorons la manière dont l’analyse portable peut enrichir la recherche sur les champignons.

L’objectif est de rendre la recherche derrière ces variétés plus facile à examiner. Un résultat utile précise ce qui a été mesuré, comment, et quel degré de confiance les données permettent.

Pourquoi rendement et composition vont de pair

Un œil exercé sait reconnaître des différences de forme, de croissance et de rendement à la récolte. Ces observations restent précieuses, mais l’aspect seul ne permet pas d’établir la composition chimique.

Le rendement enregistré et les résultats analytiques répondent à des questions différentes.
Deux récoltes peuvent peser à peu près le même poids et présenter des profils chimiques différents. Leurs résultats prennent tout leur sens lorsque les détails de l’échantillon et les méthodes de mesure sont consignés avec eux.

Comment Valenveras transforme la lumière en données

Dans le protocole analytique décrit pour cette recherche,
le système associe un matériel optique à des modèles analytiques développés par Valenveras. Le matériel capte un signal optique ; le modèle analytique lui donne un sens que les chercheurs peuvent interpréter et consigner.

FT-NIR signifie spectroscopie proche infrarouge à transformée de Fourier.
Un instrument éclaire l’échantillon et enregistre sa réponse à la lumière proche infrarouge. Le spectre obtenu contient des signaux superposés liés à la composition et aux propriétés physiques de l’échantillon.
Des modèles chimiométriques, entraînés sur des résultats de laboratoire de référence, exploitent ces motifs pour estimer des caractéristiques chimiques définies.

Le scan optique peut être rapide et non destructif.
Son utilité dépend d’une méthode de préparation des échantillons adaptée et d’un modèle correspondant au matériau analysé. Cette combinaison peut rendre la collecte d’informations analytiques plus régulière et plus pratique.

Pourquoi les mesures de référence sont essentielles

Un modèle NIR quantitatif dépend de la qualité de ses mesures de référence et d’une validation sur des échantillons qu’il n’a pas encore appris. Les informations de performance utiles comprennent les composés couverts, la plage de concentration et l’erreur observée
lorsque les prédictions sont comparées à une méthode de référence appropriée.

Pour la recherche sur les champignons, ces contrôles doivent porter sur des échantillons de champignons et sur le modèle analytique précis utilisé. Le criblage rapide offre un premier aperçu pratique, tandis que l’analyse en laboratoire de référence permet de valider et de confirmer. Les deux approches peuvent se compléter.

L’apport de Full Canopy Genetics

Full Canopy Genetics apporte la recherche mycologique et le développement de variétés associés à MycoBag. Sa collaboration avec Valenveras ajoute des données analytiques aux observations recueillies au cours de ce travail.

La valeur vient du lien entre chaque résultat et son contexte. Une étiquette d’échantillon, une récolte enregistrée et un résultat analytique doivent se rapporter au même matériau pour permettre une comparaison pertinente.

Avec le temps, un dossier de recherche bien documenté peut faciliter l’examen des résultats. Il peut aussi montrer où une tendance apparente nécessite encore une confirmation indépendante.

Lire le graphique rendement et composition

Les premiers graphiques du programme réunissent rendements enregistrés et résultats analytiques dans une même vue. Ces synthèses visuelles utilisent des positions approximatives et donnent une vue d’ensemble des observations. Mieux vaut les lire comme une introduction à la recherche et réserver les comparaisons précises aux données sources vérifiées.

Dans le graphique rendement/puissance, la « puissance » correspond aux alcaloïdes totaux sur base brute (as-is). Il s’agit de la concentration indiquée dans l’échantillon tel qu’analysé, et non de la seule psilocybine. L’axe du rendement est exprimé en onces par unité et par récolte. Ces libellés comptent, car les comparaisons reposent sur des définitions communes et des bases de mesure cohérentes.

Les points affichés couvrent plusieurs combinaisons de rendement enregistré et de concentration. Leur disposition ne suffit pas, à elle seule, à établir la force de la relation entre ces mesures
ni à démontrer l’absence de compromis entre elles.

Hydra apparaît dans la partie supérieure droite de cette illustration, aux côtés de quelques autres entrées. Cette position est une observation au sein de ce jeu de données, et non une garantie du comportement de chaque échantillon MycoBag.

La taille des bulles représente le nombre de récoltes enregistrées. Une bulle plus grande ne signifie pas automatiquement un résultat plus précis ou plus stable :
des scans répétés, plusieurs échantillons d’une même récolte et des récoltes indépendantes constituent des types de preuves différents. L’incertitude dépend aussi de la variabilité et de la méthode analytique.

Figure 1. Rendement par rapport à la concentration indiquée d’alcaloïdes totaux.
Les positions affichées sont approximatives et ne doivent pas être interprétées comme des valeurs garanties.

Ce que le graphique de distribution peut nous apprendre

Le second graphique examine la dispersion des concentrations indiquées.
Sa légende décrit chaque boîte comme les 50 % centraux des résultats,
, avec une ligne indiquant la médiane et des moustaches montrant la plage indiquée. Cela apporte une information qu’une simple moyenne masquerait.

Les lignes « Medium », « High » et « Ultra-High » sont des repères de référence internes. Elles décrivent des catégories utilisées au sein du programme, et non des normes scientifiques ou de sécurité reconnues.

Hydra 2026 présente une boîte relativement compacte dans l’illustration fournie. Cela suggère une dispersion plus étroite parmi les observations affichées, mais cela ne suffit pas , à lui seul, à établir une stabilité génétique ou une répétabilité dans différents contextes.

Le graphique comprend aussi des entrées désignées comme chapeaux et pieds, ainsi que des noms associés à différentes années. Il ne s’agit pas automatiquement de groupes équivalents. Le type d’échantillon et la cohorte doivent rester visibles lors de l’interprétation des résultats.

Une seule observation ne peut pas démontrer une constance. Même une distribution étroite nécessite un nombre d’échantillons indépendants et une explication de la façon dont les observations ont été recueillies avant que le lecteur puisse juger de la portée du résultat.

Figure 2. Distribution des concentrations indiquées d’alcaloïdes totaux.
Les boîtes résument des observations enregistrées et ne doivent pas être interprétées comme une preuve de stabilité génétique.

Ce que les graphiques ne démontrent pas

Il s’agit de synthèses d’observations. La génétique, l’environnement, l’échantillonnage et la mesure peuvent tous contribuer aux tendances observées. Séparer ces effets demande davantage de preuves que les figures seules.

Leur intérêt immédiat est de faciliter la discussion sur les données. Elles montrent pourquoi une moyenne a besoin de contexte et pourquoi une observation prometteuse doit être distinguée d’un résultat confirmé de manière indépendante.

Hydra et la prochaine étape de la recherche MycoBag

Hydra fait partie du catalogue actuel de MycoBag et figure aussi dans les données de recherche présentées ici. C’est donc un bon exemple des questions qu’explore cette collaboration.

Pour nous, Hydra est l’occasion de rendre cette recherche plus visible.
À mesure que la recherche avance, nous voulons que les lecteurs comprennent les questions derrière cette variété, la façon dont ses mesures ont été évaluées et les résultats qui ont été confirmés.

MycoBag continue également de documenter d’autres variétés. L’objectif est de donner à chacune une histoire de recherche claire, avec des affirmations fidèles aux preuves disponibles plutôt que de transformer des observations préliminaires en garanties.

À propos de l’auteur

Ruben Valenzuela Moreno est ingénieur agronome, industriel et designer, cofondateur de MycoBag et de Valenveras. Son travail relie la recherche mycologique et la technologie analytique. Cet article décrit une collaboration à laquelle il participe directement.